Logiciel de comptabilité pour SCI : lequel choisir en 2025 ?

Dernière mise à jour le 16 juin 2025 · 10 min

Vous gérez une société civile immobilière et vous cherchez le meilleur logiciel de comptabilité pour SCI ? Entre les obligations fiscales, la répartition des charges entre associés ou encore la gestion des loyers, tenir la comptabilité d’une SCI peut vite devenir un casse-tête… à moins d’avoir l’outil adapté. Pourtant, beaucoup de gestionnaires continuent à jongler avec des tableurs inadaptés.

Quel logiciel choisir pour simplifier vos démarches ? Pourquoi utiliser un logiciel de comptabilité pour une SCI ? Comment bien choisir son logiciel ? Retrouvez toutes les réponses à vos questions dans ce guide.

Lorsqu’on gère une SCI, la comptabilité ne peut pas être prise à la légère. Même si cette structure est souvent choisie pour sa souplesse, elle reste soumise à un certain formalisme comptable, surtout lorsqu’elle est imposée à l’impôt sur les sociétés (IS). Pour gagner en sérénité, beaucoup de gérants de SCI choisissent aujourd’hui de s’appuyer sur un logiciel de comptabilité. Et ce choix est loin d’être anodin.

Respecter les obligations légales et fiscales

Tenir une comptabilité rigoureuse est une obligation pour toute SCI, quel que soit son régime fiscal. En cas d’option pour l’IS, il faut produire chaque année un bilan, un compte de résultat et une annexe, puis les déposer au greffe. Même à l’impôt sur le revenu (IR), le gérant doit rendre des comptes aux associés.

Un logiciel de comptabilité permet de respecter ces exigences sans s’y perdre. Il structure les données, évite les oublis, et facilite la préparation des déclarations fiscales. En cas de contrôle de l’administration, vous serez prêt.

Gagner du temps et réduire les erreurs

Gérer la comptabilité à la main, ou sur un simple tableur, peut vite devenir chronophage. Un bon logiciel permet d’automatiser de nombreuses tâches : synchronisation avec le compte bancaire, génération des écritures comptables à partir des factures, calcul de la TVA si besoin…

Résultat : un gain de temps considérable et moins de risques d’erreurs. Vous pouvez vous concentrer sur la gestion de vos biens, sans passer vos soirées à trier des justificatifs.

Avoir une vision claire de la situation financière

Les logiciels de comptabilité modernes offrent souvent des tableaux de bord très visuels. Vous pouvez y suivre votre trésorerie, vos recettes locatives, vos charges, la rentabilité par bien, etc.

Cette visibilité est précieuse pour prendre de bonnes décisions : prévoir des travaux, ajuster les loyers, acheter ou vendre un bien. En un coup d’œil, vous savez où en est votre SCI.

Mieux collaborer entre associés

En SCI, les décisions se prennent souvent à plusieurs. Avec un logiciel, vous pouvez facilement partager les informations comptables avec vos coassociés, voire avec un expert-comptable si vous en avez un.

Cela favorise la transparence, évite les malentendus, et rend les assemblées générales plus efficaces : les chiffres sont disponibles, clairs, et à jour.

Sécuriser et centraliser vos données

Autre avantage non négligeable : la sécurité. En utilisant un logiciel, vos données sont généralement stockées dans le cloud, sauvegardées régulièrement, et protégées contre les pertes accidentelles.

De plus, tous vos justificatifs (factures, quittances, relevés bancaires) peuvent être archivés au même endroit. En cas de contrôle fiscal, tout est accessible en quelques clics.

Réduire les coûts de gestion

Un logiciel de comptabilité représente également une solution économique, surtout si vous gérez une petite SCI à l’IR. Pour quelques euros par mois – voire gratuitement pour certaines offres – vous disposez d’un outil complet, là où un expert-comptable pourrait coûter plusieurs centaines d’euros par an.

Pour une SCI simple, cela suffit souvent amplement. Et si votre structure devient plus complexe, vous pourrez toujours faire évoluer l’outil ou déléguer à un professionnel.

La comptabilité d’une SCI (Société Civile Immobilière) varie selon son régime fiscal. Certaines structures sont soumises à des règles très allégées, tandis que d’autres doivent respecter les mêmes obligations qu’une société commerciale. Faisons le point.

SCI à l’impôt sur le revenu (IR)

La grande majorité des SCI sont soumises par défaut à l’impôt sur le revenu (IR). Dans ce cas, les obligations comptables sont relativement légères, car la société n’est pas considérée comme exerçant une activité commerciale.

Concrètement, la SCI n’a pas l’obligation de tenir une comptabilité commerciale complète. Toutefois, il est fortement recommandé (et parfois exigé en cas de contrôle fiscal) de mettre en place une comptabilité simplifiée, avec :

• un registre chronologique des recettes et dépenses

• la conservation de toutes les pièces justificatives (factures, relevés bancaires…)

• un compte bancaire dédié aux opérations de la SCI

• l’établissement d’un rapport de gestion présenté lors d’une assemblée générale annuelle

Chaque année, la SCI doit également remplir une déclaration fiscale via le formulaire n° 2072, qui sert à répartir le résultat (ou le déficit) entre les associés. Ces derniers intègrent ensuite leur quote-part dans leur propre déclaration d’impôt sur le revenu.

SCI à l’impôt sur les sociétés (IS)

Dès qu’une SCI opte pour l’impôt sur les sociétés (IS), ou exerce une activité commerciale (par exemple en meublé ou en construction-vente), elle entre dans un cadre comptable plus rigoureux.

Elle doit alors tenir une comptabilité d’engagement en partie double, conformément au plan comptable général. Cela implique :

• la tenue de livres comptables obligatoires (journal, grand livre, livre d’inventaire)

• l’établissement de comptes annuels : bilan, compte de résultat et annexes

• la déclaration de résultats via le formulaire n° 2065 (liasse fiscale)

• le dépôt des comptes au greffe du tribunal de commerce

• la déclaration et le paiement de la TVA, si la SCI y est assujettie

La SCI doit également organiser une assemblée générale annuelle pour approuver les comptes et présenter un rapport de gestion. Un compte bancaire professionnel distinct est également obligatoire.

Quelques cas particuliers

Même une SCI à l’IR peut se voir imposer une comptabilité commerciale si elle :

• dépasse certains seuils de chiffre d’affaires ou d’effectif

• compte parmi ses associés une personne morale soumise à l’IS

• réalise une activité de location meublée représentant une part significative de ses revenus

• est soumise à la TVA

Certaines SCI prévoient dans leurs statuts l’obligation de tenir une comptabilité complète, même si la loi ne l’impose pas. Il est donc important de bien relire les statuts pour connaître les obligations internes.

La comptabilité d’une SCI peut se révéler plus ou moins complexe selon le régime fiscal choisi (IR ou IS), le nombre d’associés, le volume d’opérations, ou encore la nature des locations (vide ou meublée). 

Pour bien gérer votre SCI, vous pouvez opter pour l’une des trois solutions suivantes : Excel, un logiciel de comptabilité, ou un accompagnement par un expert-comptable. Voici un comparatif détaillé pour vous aider à choisir.

Tenir la comptabilité d’une SCI avec Excel

Utiliser un tableur comme Excel ou Google Sheets peut suffire si vous gérez une SCI très simple : un seul bien loué vide, peu d’associés, peu d’opérations par an, et un régime fiscal à l’impôt sur le revenu (IR). Dans ce cas, la comptabilité se limite souvent à :

• enregistrer les loyers encaissés et les charges payées (taxe foncière, assurance, frais bancaires, etc.)

• suivre les apports des associés et les éventuels remboursements

• ventiler les intérêts d’emprunt, s’il y a un crédit immobilier

• calculer le résultat fiscal à répartir entre les associés

L’avantage d’Excel réside dans sa simplicité. Il permet aussi une bonne visibilité si vous structurez bien vos tableaux (par exemple en séparant recettes, dépenses, suivi bancaire, répartition entre associés…).

Mais il faut rester vigilant, car Excel n’automatise rien, ne sécurise pas les données (risque d’erreurs manuelles) et n’est pas conforme aux exigences comptables si votre SCI est à l’IS ou si vous êtes contrôlé. Il convient donc à une gestion basique, mais pas au-delà.

Utiliser un logiciel de comptabilité

Si votre SCI gère plusieurs biens, est soumise à l’impôt sur les sociétés (IS), a plusieurs associés ou effectue des travaux importants, un logiciel de comptabilité devient presque indispensable. Cet outil permet de :

• saisir automatiquement ou manuellement vos écritures comptables (recettes, charges, amortissements, emprunts…)

• tenir les livres obligatoires (livre journal, grand livre)

• éditer les comptes annuels (bilan, compte de résultat, annexe) en fin d’exercice

• produire le fichier FEC, exigé par l’administration en cas de contrôle

• parfois, générer la liasse fiscale et transmettre les déclarations en ligne

Ces solutions sont souvent proposées par abonnement mensuel ou annuel, avec des tarifs variables selon les fonctionnalités. Elles offrent un bon compromis entre autonomie et conformité, surtout si vous avez un minimum de connaissances en comptabilité ou si vous souhaitez suivre de près les performances de votre SCI.

👉 Découvrez le logiciel de comptabilité Clementine pour gérer la comptabilité de votre SCI

Faire appel à un expert-comptable

Dès que la gestion comptable de la SCI devient plus technique, il est fortement recommandé de vous faire accompagner par un expert-comptable. C’est notamment le cas :

• si votre SCI est à l’IS et doit respecter la comptabilité d’engagement

• si vous réalisez des travaux déductibles, avec création de déficit foncier

• si vous avez recours à la location meublée, entraînant un changement de régime fiscal (BIC)

• si vous effectuez des apports en capital, des cessions de parts sociales ou des modifications statutaires

• ou tout simplement si vous manquez de temps ou de compétences comptables

L’expert-comptable s’occupe alors de l’ensemble de la comptabilité : tenue des journaux, déclarations fiscales, calcul des résultats, rédaction de la liasse fiscale… Il peut également vous conseiller sur l’optimisation fiscale, les risques de requalification ou les meilleures pratiques pour la gestion locative.

C’est une solution plus coûteuse qu’un logiciel, mais elle apporte un vrai confort et une sécurité juridique.

Avant de choisir un logiciel de comptabilité ou un accompagnement professionnel, il est important d’identifier précisément les besoins spécifiques de votre SCI. Cela vous permettra de sélectionner les outils les plus adaptés à votre situation et d’éviter des dépenses inutiles.

Posez-vous les bonnes questions :

• Quel est le régime fiscal de votre SCI ?

• Combien de biens gérez-vous ?

• Votre SCI a-t-elle des spécificités ?

• Souhaitez-vous gérer la comptabilité vous-même ou déléguer ?

• Avez-vous des obligations fiscales précises ?

En répondant à ces questions, vous serez en mesure de mieux définir vos besoins fonctionnels (automatisation, suivi des loyers, gestion des amortissements, déclaration fiscale…) et de choisir un logiciel ou un accompagnement adapté, qu’il soit basique ou expert.

Gérer une SCI implique de nombreuses obligations comptables et fiscales. Pour rester conforme tout en simplifiant la gestion quotidienne, il est essentiel de choisir un logiciel adapté. Parmi les solutions disponibles, le logiciel de comptabilité Clementine se distingue aujourd’hui comme l’un des meilleurs outils pour les SCI.

Notre logiciel a été conçu pour répondre aux particularités des SCI, qu’elles soient imposées à l’IR ou à l’IS. Le logiciel permet notamment de :

• ✅ Synchroniser automatiquement vos comptes bancaires

• ✅ Suivre vos revenus locatifs, charges et répartitions entre associés

• ✅ Gérer la TVA si votre SCI y est assujettie

• ✅ Produire les documents comptables obligatoires (bilan, compte de résultat, liasse fiscale)

• ✅ Centraliser vos justificatifs et notes de frais grâce à une application mobile avec scan des reçus

Le logiciel Clementine est disponible sous plusieurs formules, allant d’une version gratuite pour la facturation, à une offre complète incluant la gestion de la TVA et la production du bilan annuel. Les tarifs sont pensés pour s’adapter à la taille et aux besoins de chaque structure : vous ne payez que pour les fonctionnalités dont vous avez réellement besoin.

👉 Découvrez dès maintenant le logiciel de comptabilité Clementine, pour simplifier votre comptabilité et gagner du temps au quotidien !

Est-il obligatoire d’avoir un comptable pour une SCI ?

Avoir un comptable n’est pas obligatoire pour une SCI. Cependant, il est fortement recommandé, surtout si elle est soumise à l’IS, car la tenue d’une comptabilité complète, l’établissement des comptes annuels et des déclarations fiscales exigent des compétences techniques.

Quel est le prix d’un comptable pour une SCI ?

Le prix d’un comptable pour une SCI varie entre 80 € et 200 €/mois selon la complexité. L’accompagnement d’un expert-comptable en ligne permet de réduire les coûts tout en restant conforme, avec des offres dès 49 €/mois.

Comment faire sa comptabilité tout seul ?

Pour faire sa comptabilité seul, utilisez un logiciel adapté, enregistrez toutes les opérations, tenez les livres comptables obligatoires et établissez les comptes annuels. Cela demande rigueur, organisation et quelques bases en comptabilité.